微生物代谢国家重点实验室（上海交通大学）是2011年4月经科技部批准立项建设的国家级科研机构，依托上海交通大学开展微生物代谢领域的基础与应用研究。实验室由中国科学院院士邓子新任主任，聚焦合成代谢、分解代谢与代谢互作三大研究方向，在DNA硫化修饰、抗生素生物合成等领域取得多项国际影响力成果 [3]。
实验室拥有分布于徐汇校区和闵行校区的科研设施 ，配备先进实验设备，承担微生物学、生物工程等学科的国家级科研任务。其团队通过基础研究与技术转化的结合，持续推进微生物代谢机制解析与产业化应用，同时开展生态文明科普等社会服务工作。


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